Ada Versi Omicron Baru, Ahli Usul Pisahkan Garis Keturunan

Jarum suntik medis dan botol terlihat di depan teks Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 di latar belakang. (ANTARA/Pavlo Gonchar/SOPA Images via Reuters)

TEMPO.CO, Jakarta - Para ilmuwan telah mengidentifikasi versi tambahan dari Covid-19 varian Omicron, yang juga membawa banyak mutasi, tapi tidak memiliki satu keunikan genetik utama.

Direktur University College London Genetics Institute, Inggris, Francois Balloux,  mengusulkan agar memisahkan garis keturunan Omicron yang dikenal sebagai varian B.1.1.529 menjadi dua subgaris keturunan BA.1 dan BA.2. BA.1 untuk versi Omicron yang awalnya diidentifikasi, dan B.2, untuk versi yang baru ditemukan.

Pemisahan itu disarankan dan diterapkan dalam beberapa hari terakhir di Cov-Lineage, sistem online yang digunakan untuk mendokumentasikan garis keturunan SARS-CoV-2 (virus penyebab Covid-19) dan penyebarannya.  

"Ada dua garis keturunan dalam Omicron, BA.1 dan BA.2, yang cukup berbeda secara genetik. Kedua garis keturunan mungkin berperilaku berbeda,” ujar Balloux dalam laporan Kamis, 9 Desember 2021.

Satu perbedaan utama antara dua sublineage mungkin membuat BA.2 sedikit lebih sulit untuk dilacak, sementara BA.1 memiliki ‘penghapusan’ pada gen yang mengkode protein spike, yang digunakan virus untuk menginfeksi sel.

Penghapusan ini, yang disebut singkatnya 69-70del, menghilangkan enam basa dari keseluruhan urutan RNA, yang pada gilirannya menghapus dua ‘blok pembangun’ dari protein spike akhir, menurut Americal Society for Microbiology.

Tes PCR memindai beberapa gen pada virus corona, termasuk gen protein spike ini, tapi varian dengan 69-70del tidak akan diuji positif untuk spike. Sebaliknya, mereka menyebabkan tes PCR menampilkan kesalahan yang berbunyi ‘Kegagalan target gen S’.

Kekhasan ini sebenarnya membuat varian dengan 69-70del, yaitu Omicron dan Alpha, lebih mudah dikenali di PCR. Setelah menandai kasus seperti itu, para ilmuwan kemudian menguji sampel melalui analisis genomik lengkap, untuk mengonfirmasi varian mana yang menyebabkan infeksi tertentu. 

"Keluarnya gen S sangat penting untuk mendapatkan pengamatan cepat di banyak bagian berbeda di Afrika Selatan, dengan demikian melacak penyebaran sublineage BA.1,” kata Sarah Otto, profesor biologi evolusi di University of British Columbia.

Namun, BA.2 tidak membawa mutasi 69-70del, yang berarti tidak akan menonjol dari varian lain pada tes PCR standar dan para ilmuwan mungkin perlu mencari lebih keras untuk menemukannya. Sejauh ini, ada tujuh kasus BA.2 yang dilaporkan secara global, dengan kasus muncul di Afrika Selatan, Australia dan Kanada.

Profesor biologi struktural di University of Oxford, David Stuart, mengatakan meskipun ada sejumlah perbedaan antara dua subgaris keturunan Omicron, tidak ada alasan langsung untuk berpikir bahwa yang satu akan berperilaku berbeda dari yang lain. Dia juga tidak berpikir untuk menjelaskan bahwa versi Omicron baru lebih merupakan ancaman daripada bentuk Omicron yang sedang melanda Inggris saat ini. “Karena ini masih sangat dini.”

LIVE SCIENCE | AMERICAN SCIETY FOR MICROBIOLOGY | FINANCIAL TIMES

Baca:
CEO Pfizer: Dosis Keempat Vaksin Mungkin Perlu untuk Melawan Omicron

Selalu update info terkini. Simak breaking news dan berita pilihan dari Tempo.co di kanal Telegram “Tempo.co Update”. Klik https://t.me/tempodotcoupdate untuk bergabung. Anda perlu meng-install aplikasi Telegram terlebih dahulu.






Pembatasan Dihapus, Jumlah Perjalanan di Cina Saat Libur Imlek Meningkat

11 menit lalu

Pembatasan Dihapus, Jumlah Perjalanan di Cina Saat Libur Imlek Meningkat

Tahun Baru Imlek adalah hari libur terpenting tahun ini di Cina.


Kementerian Kesehatan Persiapkan Vaksinasi Covid-19 untuk Bayi dan Balita

27 menit lalu

Kementerian Kesehatan Persiapkan Vaksinasi Covid-19 untuk Bayi dan Balita

Kementerian Kesehatan akan melakukan upaya sosialisasi vaksinasi Covid-19 untuk balita kepada masyarakat.


Jepang Samakan Covid-19 dengan Flu Biasa, Aturan Wajib Masker Dicabut

17 jam lalu

Jepang Samakan Covid-19 dengan Flu Biasa, Aturan Wajib Masker Dicabut

Jepang tak lagi mewajibkan pemakaian masker di dalam ruangan. Covid-19 disamakan dengan sakit flu biasa.


Inilah Kuota Haji Indonesia dalam 7 Tahun Terakhir

1 hari lalu

Inilah Kuota Haji Indonesia dalam 7 Tahun Terakhir

Sebelum pandemi Covid-19, tepatnya pada 2019, Indonesia mendapatkan kuota haji sebesar 231.000 jemaah.


Cegah Lonjakan Kasus Covid-19 di Masa Transisi Menuju Endemi, Heru Budi Tetapkan 4 Kegiatan

1 hari lalu

Cegah Lonjakan Kasus Covid-19 di Masa Transisi Menuju Endemi, Heru Budi Tetapkan 4 Kegiatan

Penjabat (Pj) Gubernur DKI Jakarta Heru Budi Hartono resmi mencabut aturan Pemberlakukan Pembatasan Kegiatan Masyarakat (PPKM).


Pakar Ingatkan Campak Lebih Menular dari COVID-19

1 hari lalu

Pakar Ingatkan Campak Lebih Menular dari COVID-19

Pakar kesehatan mengatakan penyakit campak lebih menular dari COVID-19 dengan daya tular pada 12 hingga 13 orang di sekitar pasien.


CDC Temukan Kasus Stroke Pada Lansia Penerima Vaksin Booster Pfizer

1 hari lalu

CDC Temukan Kasus Stroke Pada Lansia Penerima Vaksin Booster Pfizer

Dalam temuannya, CDC menyatakan lansia penerima vaksin booster Covid-19 Pfizer kedua kalinya berpotensi terkena stroke.


Kraken Masuk Indonesia, Tetap Patuhi Protokol Kesehatan dan Vaksinasi Booster

1 hari lalu

Kraken Masuk Indonesia, Tetap Patuhi Protokol Kesehatan dan Vaksinasi Booster

Pakar mengatakan apapun varian COVID-19, termasuk XBB.1.5 atau Kraken, protokol kesehatan belum berubah dan vaksin masih bermanfaat.


Yuni Shara Vaksinasi Booster ke-2 di RSPAD Gatot Soebroto, Rasanya Seperti...

2 hari lalu

Yuni Shara Vaksinasi Booster ke-2 di RSPAD Gatot Soebroto, Rasanya Seperti...

Yuni Shara sengaja menggunakan gaun tanpa lengan agar memudahkannya menerima suntikan vaksin di lengan kirinya.


Harga Minyak Dunia Naik 1 Persen, Terpengaruh Aktivitas Ekonomi Cina

2 hari lalu

Harga Minyak Dunia Naik 1 Persen, Terpengaruh Aktivitas Ekonomi Cina

Harga minyak dunia naik 1 persen karena ekspektasi permintaan menguat dipicu menggeliatnya aktivitas ekonomi Cina.