3. Mereka membawa tambahan mutasi yang pantas dikhawatirkan
Mutasi-mutasi baru hampir selalu mengiringi evolusi SARS-CoV-2. Tapi, mereka hanya menjadi penting jika menambah parah gejala infeksi virus tersebut, menambah kemampuannya mengalahkan imun tubuh hasil vaksinasi atau infeksi sebelumnya, atau membuat lebih sulit dideteksi sehingga lebih sulit pula mengendalikan penyebaran penyakitnya.
Omicron BA.4 dan BA.5 berbagi banyak mutasi yang sama dengan Omicron orisinal (BA.1 dan BA.2) namun lebih banyak kesamaannya yang dengan BA.2. Mereka juga memiliki sejumlah mutasi tambahan, yang beberapa di antaranya bisa mengubah karakteristik virus.
Omicron BA.4 dan BA.5 kerap dibahas bersama karena mutasi-mutasi pada gen di bagian protein paku keduanya identik, meski mereka bisa berbeda dalam mutasi gen di lokasi lainnya. Protein paku penting karena bagian ini yang digunakan virus untuk menginfeksi sel manusia, dan karenanya menentukan seberapa mudah virus itu bisa ditularkan. Protein paku pula yang jadi bagian dari virus yang digunakan dalam produksi kebanyakan vaksin Covid-19.
Baik Omicron BA.4 maupun Omicron BA.5 membawa sebuah mutasi gen yang dinamakan L452R, yang juga pernah dideteksi ada pada varian Delta. Mutasi gen itu yang diduga membuat dua subvarian Omicron ini lebih menular dengan mutasi gen itu menambah kemampuan virus menempel ke sel manusia. Mutasi gen itu mungkin menolong memberi separuh peran untuk kemampuan menghindari penghancuran oleh sel-sel imun dalam tubuh.
Mereka juga memiliki perubahan genetik yang disebut mutasi F486V, dekat lokasi potein paku mereka terikat ke sel manusia. Ini yang diduga memberi separuh peran sisanya dalam menghindari respons imun tubuh.
Tidak seperti Omicron subvarian BA.2 yang siluman, kebanyakan hasil genome sequencing BA.4 dan BA.5 berisi pula perubahan genetik yang mempengaruhi hasil bacaan tes PCR, menuntun kepada fenomena yang disebut S Gene Target Failure (SGTF). Ini menyediakan cara pelacakan infeksi virusnya yang lebih cepat di negara-negara di mana BA.2 pernah dominan.