Sementara karir dan reputasinya berkembang dan tumbuh, kehidupan pribadi Nash menjadi semakin kompleks. Hubungannya dengan seorang perawat di Boston, Eleanor Stier, membuahkan seorang putra, John David Stier, pada 1953. Nash juga memiliki serangkaian hubungan dengan sesama laki-laki. Pada musim panas 1954 ia ditangkap di kamar mandi pria sedang melakukan tindakan tak senonoh.
Dan, keraguan tentang kemampuannya menggerogoti dirinya. Dua penghargaan tertinggi di bidang matematika, Kompetisi Putnam dan Fields Medal, tidak berhasil diraihnya.
Pada 1957, setelah dua tahun menjalani putus-sambung pacaran, ia menikahi Alicia Larde, seorang kepala fisika MIT dari keluarga aristokrat Amerika Tengah dan salah satu dari hanya 16 perempuan dari kelas 1955. "Dia sangat, sangat tampan, sangat cerdas," kata Alicia pada Sylvia Nasar.
Namun, di awal 1959, saat istrinya mengandung putra mereka, John, Nash mulai berubah. Kecemerlangan otaknya berubah menjadi kengerian, yang membawanya ke dalam sifat paranoia dan delusi. Pada April ia dirawat di Rumah Sakit McLean, menjalani terapi bagi orang sakit jiwa bersama dengan, antara lain, penyair Robert Lowell.
Itu adalah awal penurunan tajam prestasinya. Setelah melewati prosedur rawat inap, Nash harus menjalani terapi kejut listrik dan beristirahat sementara ke Eropa. Ia mengirimkan kartu pos rahasia kepada rekan-rekan dan anggota keluarganya. Selama bertahun-tahun ia menelusuri kampus Princeton, sendirian melewati Fine Hall tempat ia pernah menunjukkan prestasi matematika yang mengejutkan.